Thomas se réveille amnésique dans une cage qui le dépose au Bloc, un étrange carré formant le centre d'un gigantesque Labyrinthe.Il débarque au milieu d'une communauté d'adolescents, des garçons ayant tous perdu la mémoire, qui ont réussi à se structurer...

Thomas se réveille amnésique dans un lieu étrange, The Glade, où il se retrouve accueilli par une communauté de jeunes garçons vivant là en autarcie. Autour de ce lieu se dressent d'immenses murs renfermant un labyrinthe dont les murs changent de configuration...